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Cmb
Moderatore
Città: Buers
Prov.: Estero
Regione: Austria
12844 Messaggi
Flora e Fauna |
 Inserito il - 04 ottobre 2011 : 08:03:18
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Reappraisal of the ‘‘Molecular phylogeny of Western Palaearctic Helicidae s.l. (Gastropoda: Stylommatophora)’’: When poor science meets GenBank (2011)
Dick S.J. Groenenberg a, Eike Neubert b, Edmund Gittenberger a,c
a Netherlands Centre for Biodiversity Naturalis, P.O. Box 9517, NL 2300 RA Leiden, The Netherlands
b Naturhistorisches Museum der Burgergemeinde Bern, Bernastrasse 15, CH-3005 Bern, Switzerland
c Institute of Biology, Leiden University, Sylvius Lab., P.O. Box 9505, NL 2300 RA Leiden, The Netherlands
a b s t r a c t
A paper on the ‘Molecular phylogeny of Western Palaearctic Helicidae s.l.’, published by Steinke et al. (2004) in this journal, is critically analysed. Several obvious errors are corrected and methodological weaknesses are revealed. BLAST searches on the sequences published in that paper and now in GenBank, showed high percentages of similarity of the alleged species with taxa that are considered only distantly related in the literature. Inspection of the so-called voucher specimens showed that some shells were misidentified, whereas others contained dirt or were bleached, indicating that these had been collected
empty. Obviously the sequences published for those species could not have originated from those specimens, which cannot be considered vouchers therefore, even if they are from the same locality. In other instances, spurious sequences were published for correctly identified voucher specimens. For several species for which we collected specimens ourselves, the COI or the 16S sequence, or both, clearly differed from the results published by Steinke et al. The consequences of our results for the molecular data on helicid gastropods and their classification are listed.
Steinke, D., Albrecht, C., Pfenninger, M., 2004. Molecular phylogeny and character evolution in the western Palaearctic Helicidae s.l. (Gastropoda: Stylommatophora). Mol. Phyl. Evol. 32, 724–734.
Chi lavora con Steinke & al. (2004) deve studiare la critica di 2011
"La distinction des espèces de limaces est extrêmement difficile,
et aucun zoologiste n’est encore parvenu à quelque chose
d’un peu satisfaisant sous ce rapport."
H. M. DUCROTAY DE BLAINVILLE 1823
Vieni nel mondo dei Limax d'Italia
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ang
Moderatore
Città: roma
Regione: Lazio
11322 Messaggi
Tutti i Forum |
Inserito il - 04 ottobre 2011 : 09:31:02
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grazie per la segnalazione, vado a leggerlo
ciao
ang |
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Subpoto
Moderatore
Città: Roma
Prov.: Roma
Regione: Lazio
9027 Messaggi
Tutti i Forum |
Inserito il - 04 ottobre 2011 : 12:07:43
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Lavoro veramente interessante che ha evidenziato i grossolani errori commessi nella precedente revisione, questi errori difficilmente possono essere imputabili ad errori di classificazione degli esemplari molto diversi tra loro e facilmente identificabili anche da persone non particolarmente esperte ma più probabilmente ad qualche errore nel metodo di sequenziamento.
Molto importante sarà il GenBank per studi futuri in cui sarà possibile confrontare le sequenze anche senza avere materialmente gli esemplari a disposizione ma vi dovrebbe essere un maggior rigore nella classificazione dei dati rendendo confrontabili solo quelli di cui la determinazione è sicura.
Dagli studi recenti sta emergendo la presenza di molte specie criptiche difficilmente separabili con i metodi tradizionali,l'utilizzo per ogni specie di sequenze di esemplari topotipici ridurrebbe di molto la possibilità di errori.
Per spiegarmi meglio, vedo tra le specie sequenziate Monacha martensiana, ma non c'è niente di più confuso di questa specie,spesso gli si attribuiscono esemplari di provenienza anche piuttosto lontana da quelle indicate dal Tiberi, per esempio nel lavoro di GARGOMINY e RIPKEN sul Parc national du
Mercantour il confronto della la specie rinvenuta nel parco e stata effettuata con esemplari provenienti da Ascoli Piceno località piuttosto lontana dalla zona tipica situata nel sud dell'Abruzzo vicino al confine con il Molise.
In quest'area piuttosto ampia che comprende la Valle dell'Aterno-Pescara e parte della Valle del Sangro sono presenti diversi morfotipi che si differenziano anche anatomicamente ma nessuno corrisponde agli esemplari di Ascoli.
Dunque per avere un'affidabilità delle sequenze depositate nel GenBank si dovrebbero accettare solamente quelle di entità specifiche ben definite ed evitare quelle di specie dubbie che potrebbero indurre ad errori delle conclusioni anche se involontari.
La natura è un libro aperto, siamo noi che non sappiamo leggerlo
Sandro |
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